Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r44Q9EQ47 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms