Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SyncQ9EPM5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SyncQ9EPM5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms