Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mrpl4Q9DCU6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl4Q9DCU6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms