Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eif3fQ9DCH4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eif3fQ9DCH4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms