Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnf6Q9DBU5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnf6Q9DBU5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnf6Q9DBU5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rnf6Q9DBU5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf6Q9DBU5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf6Q9DBU5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf6Q9DBU5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf6Q9DBU5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf6Q9DBU5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf6Q9DBU5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf6Q9DBU5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf6Q9DBU5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf6Q9DBU5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf6Q9DBU5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf6Q9DBU5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf6Q9DBU5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf6Q9DBU5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf6Q9DBU5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf6Q9DBU5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf6Q9DBU5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf6Q9DBU5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf6Q9DBU5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf6Q9DBU5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf6Q9DBU5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rnf6Q9DBU5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rnf6Q9DBU5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Rnf6Q9DBU5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rnf6Q9DBU5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rnf6Q9DBU5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rnf6Q9DBU5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rnf6Q9DBU5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rnf6Q9DBU5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rnf6Q9DBU5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf6Q9DBU5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms