Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Riok3Q9DBU3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Riok3Q9DBU3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Riok3Q9DBU3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Riok3Q9DBU3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms