Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Asf1bQ9DAP7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Asf1bQ9DAP7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Asf1bQ9DAP7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Asf1bQ9DAP7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Asf1bQ9DAP7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Asf1bQ9DAP7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Asf1bQ9DAP7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Asf1bQ9DAP7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Asf1bQ9DAP7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Asf1bQ9DAP7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Asf1bQ9DAP7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Asf1bQ9DAP7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Asf1bQ9DAP7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Asf1bQ9DAP7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Asf1bQ9DAP7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Asf1bQ9DAP7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Asf1bQ9DAP7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Asf1bQ9DAP7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Asf1bQ9DAP7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Asf1bQ9DAP7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Asf1bQ9DAP7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Asf1bQ9DAP7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Asf1bQ9DAP7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Asf1bQ9DAP7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Asf1bQ9DAP7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Asf1bQ9DAP7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Asf1bQ9DAP7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Asf1bQ9DAP7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Asf1bQ9DAP7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Asf1bQ9DAP7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Asf1bQ9DAP7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Asf1bQ9DAP7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Asf1bQ9DAP7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Asf1bQ9DAP7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Asf1bQ9DAP7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Asf1bQ9DAP7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Asf1bQ9DAP7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms