Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA6

Exosc1, Exosome complex component CSL4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc1Q9DAA6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exosc1Q9DAA6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Exosc1Q9DAA6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Exosc1Q9DAA6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Exosc1Q9DAA6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Exosc1Q9DAA6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Exosc1Q9DAA6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Exosc1Q9DAA6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms