Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA3

Uncharacterized protein C4orf36 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAA3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9DAA3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9DAA3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9DAA3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9DAA3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9DAA3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9DAA3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9DAA3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms