Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sgf29Q9DA08 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sgf29Q9DA08 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms