Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S1

UPF0193 protein EVG1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9S1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D9S1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D9S1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D9S1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D9S1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D9S1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D9S1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D9S1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D9S1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D9S1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D9S1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D9S1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D9S1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D9S1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D9S1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D9S1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D9S1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D9S1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D9S1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Q9D9S1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D9S1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D9S1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D9S1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D9S1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D9S1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D9S1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Q9D9S1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D9S1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D9S1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D9S1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D9S1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D9S1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D9S1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D9S1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D9S1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D9S1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D9S1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D9S1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D9S1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D9S1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D9S1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D9S1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Q9D9S1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D9S1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D9S1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D9S1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D9S1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D9S1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Q9D9S1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D9S1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D9S1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D9S1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D9S1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D9S1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D9S1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D9S1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D9S1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D9S1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D9S1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D9S1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D9S1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D9S1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D9S1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D9S1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D9S1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q9D9S1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D9S1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D9S1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D9S1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D9S1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D9S1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D9S1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D9S1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D9S1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D9S1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D9S1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D9S1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D9S1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D9S1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D9S1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D9S1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D9S1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D9S1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D9S1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D9S1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D9S1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D9S1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D9S1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D9S1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D9S1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D9S1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D9S1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D9S1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D9S1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D9S1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D9S1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D9S1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D9S1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D9S1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D9S1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms