Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl4Q9D8E6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl4Q9D8E6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl4Q9D8E6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms