Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Capn9Q9D805 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn9Q9D805 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms