Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MsraQ9D6Y7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MsraQ9D6Y7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MsraQ9D6Y7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MsraQ9D6Y7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MsraQ9D6Y7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MsraQ9D6Y7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MsraQ9D6Y7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MsraQ9D6Y7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MsraQ9D6Y7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MsraQ9D6Y7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MsraQ9D6Y7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MsraQ9D6Y7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MsraQ9D6Y7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MsraQ9D6Y7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MsraQ9D6Y7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MsraQ9D6Y7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MsraQ9D6Y7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MsraQ9D6Y7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MsraQ9D6Y7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MsraQ9D6Y7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MsraQ9D6Y7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MsraQ9D6Y7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms