Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J4

Necab3, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab3Q9D6J4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Necab3Q9D6J4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Necab3Q9D6J4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms