Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cmtm5Q9D6G9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms