Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms