Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab11fip1Q9D620 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Rab11fip1Q9D620 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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Rab11fip1Q9D620 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rab11fip1Q9D620 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
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