Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5J6

Shpk, Sedoheptulokinase, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShpkQ9D5J6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ShpkQ9D5J6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ShpkQ9D5J6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ShpkQ9D5J6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ShpkQ9D5J6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ShpkQ9D5J6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ShpkQ9D5J6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ShpkQ9D5J6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ShpkQ9D5J6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ShpkQ9D5J6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ShpkQ9D5J6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ShpkQ9D5J6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ShpkQ9D5J6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ShpkQ9D5J6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ShpkQ9D5J6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ShpkQ9D5J6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ShpkQ9D5J6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ShpkQ9D5J6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ShpkQ9D5J6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ShpkQ9D5J6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ShpkQ9D5J6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ShpkQ9D5J6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ShpkQ9D5J6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ShpkQ9D5J6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ShpkQ9D5J6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ShpkQ9D5J6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ShpkQ9D5J6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ShpkQ9D5J6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ShpkQ9D5J6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ShpkQ9D5J6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ShpkQ9D5J6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ShpkQ9D5J6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ShpkQ9D5J6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ShpkQ9D5J6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ShpkQ9D5J6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ShpkQ9D5J6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms