Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D4W2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D4W2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D4W2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D4W2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D4W2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D4W2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D4W2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D4W2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D4W2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D4W2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D4W2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D4W2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D4W2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D4W2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D4W2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D4W2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D4W2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D4W2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D4W2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q9D4W2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q9D4W2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D4W2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D4W2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D4W2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D4W2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D4W2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D4W2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D4W2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D4W2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D4W2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D4W2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms