Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc83Q9D4V3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc83Q9D4V3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms