Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K4

Fancd2os, FANCD2 opposite strand protein, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fancd2osQ9D4K4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fancd2osQ9D4K4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fancd2osQ9D4K4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143 ms