Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf6Q9D4J7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf6Q9D4J7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms