Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C1

Lmntd1, Lamin tail domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd1Q9D4C1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmntd1Q9D4C1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmntd1Q9D4C1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmntd1Q9D4C1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmntd1Q9D4C1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmntd1Q9D4C1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmntd1Q9D4C1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmntd1Q9D4C1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmntd1Q9D4C1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmntd1Q9D4C1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmntd1Q9D4C1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmntd1Q9D4C1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmntd1Q9D4C1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmntd1Q9D4C1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmntd1Q9D4C1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmntd1Q9D4C1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmntd1Q9D4C1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmntd1Q9D4C1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmntd1Q9D4C1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmntd1Q9D4C1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmntd1Q9D4C1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmntd1Q9D4C1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmntd1Q9D4C1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmntd1Q9D4C1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms