Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D454 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D454 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D454 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D454 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D454 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D454 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D454 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D454 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D454 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D454 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D454 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D454 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9D454 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D454 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D454 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D454 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D454 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D454 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D454 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D454 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D454 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D454 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D454 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D454 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D454 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D454 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D454 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D454 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D454 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D454 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D454 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D454 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D454 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D454 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D454 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D454 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D454 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D454 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D454 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D454 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D454 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D454 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D454 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D454 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D454 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D454 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D454 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D454 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D454 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D454 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D454 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D454 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D454 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D454 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D454 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D454 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D454 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D454 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D454 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D454 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D454 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D454 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D454 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D454 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D454 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D454 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D454 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D454 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D454 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D454 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D454 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D454 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D454 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D454 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D454 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D454 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D454 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D454 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D454 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D454 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D454 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D454 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D454 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D454 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D454 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D454 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D454 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D454 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D454 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D454 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D454 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D454 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D454 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D454 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9D454 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9D454 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9D454 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9D454 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D454 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms