Protein–RNA interactions for Protein: Q9D451

Sept12, Septin 12, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept12Q9D451 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sept12Q9D451 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sept12Q9D451 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sept12Q9D451 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sept12Q9D451 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Sept12Q9D451 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sept12Q9D451 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sept12Q9D451 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sept12Q9D451 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sept12Q9D451 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sept12Q9D451 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sept12Q9D451 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sept12Q9D451 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sept12Q9D451 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sept12Q9D451 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sept12Q9D451 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sept12Q9D451 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sept12Q9D451 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sept12Q9D451 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sept12Q9D451 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sept12Q9D451 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sept12Q9D451 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sept12Q9D451 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms