Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rsph14Q9D3W1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms