Protein–RNA interactions for Protein: Q9D387

Lamp5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp5Q9D387 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lamp5Q9D387 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms