Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snapc3Q9D2C9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms