Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nol3Q9D1X0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms