Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1T0

Lingo1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo1Q9D1T0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lingo1Q9D1T0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lingo1Q9D1T0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lingo1Q9D1T0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lingo1Q9D1T0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lingo1Q9D1T0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lingo1Q9D1T0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lingo1Q9D1T0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lingo1Q9D1T0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lingo1Q9D1T0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lingo1Q9D1T0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lingo1Q9D1T0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lingo1Q9D1T0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms