Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1R9

Rpl34, 60S ribosomal protein L34, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl34Q9D1R9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl34Q9D1R9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl34Q9D1R9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms