Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SarnpQ9D1J3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SarnpQ9D1J3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms