Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D1F3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D1F3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D1F3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D1F3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D1F3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D1F3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D1F3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D1F3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D1F3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9D1F3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9D1F3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9D1F3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms