Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Hddc3Q9D114 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hddc3Q9D114 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Hddc3Q9D114 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Hddc3Q9D114 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hddc3Q9D114 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms