Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lsm12Q9D0R8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms