Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prpsap1Q9D0M1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpsap1Q9D0M1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpsap1Q9D0M1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpsap1Q9D0M1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpsap1Q9D0M1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpsap1Q9D0M1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpsap1Q9D0M1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpsap1Q9D0M1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpsap1Q9D0M1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpsap1Q9D0M1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpsap1Q9D0M1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpsap1Q9D0M1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpsap1Q9D0M1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpsap1Q9D0M1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpsap1Q9D0M1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpsap1Q9D0M1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prpsap1Q9D0M1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms