Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc47Q9D024 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc47Q9D024 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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