Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW4

Acsl3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl3Q9CZW4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Acsl3Q9CZW4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Acsl3Q9CZW4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms