Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Utp11Q9CZJ1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Utp11Q9CZJ1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms