Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ70

3110001I22Rik, MCG129801, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110001I22RikQ9CZ70 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
3110001I22RikQ9CZ70 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
3110001I22RikQ9CZ70 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms