Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snf8Q9CZ28 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snf8Q9CZ28 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms