Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prelid3bQ9CYY7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms