Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Xrcc3Q9CXE6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Xrcc3Q9CXE6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms