Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms