Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxxc1Q9CWW7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms