Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tdrd12Q9CWU0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tdrd12Q9CWU0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms