Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn1Q9CWM4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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