Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx2Q9CWK8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx2Q9CWK8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx2Q9CWK8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx2Q9CWK8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx2Q9CWK8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx2Q9CWK8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx2Q9CWK8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx2Q9CWK8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx2Q9CWK8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx2Q9CWK8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx2Q9CWK8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx2Q9CWK8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx2Q9CWK8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx2Q9CWK8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx2Q9CWK8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx2Q9CWK8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx2Q9CWK8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx2Q9CWK8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx2Q9CWK8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx2Q9CWK8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms