Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW46

Raver1, Ribonucleoprotein PTB-binding 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver1Q9CW46 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Raver1Q9CW46 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Raver1Q9CW46 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Raver1Q9CW46 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Raver1Q9CW46 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Raver1Q9CW46 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Raver1Q9CW46 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Raver1Q9CW46 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Raver1Q9CW46 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Raver1Q9CW46 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Raver1Q9CW46 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Raver1Q9CW46 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Raver1Q9CW46 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Raver1Q9CW46 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Raver1Q9CW46 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Raver1Q9CW46 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Raver1Q9CW46 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Raver1Q9CW46 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Raver1Q9CW46 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Raver1Q9CW46 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Raver1Q9CW46 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Raver1Q9CW46 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Raver1Q9CW46 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Raver1Q9CW46 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Raver1Q9CW46 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Raver1Q9CW46 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Raver1Q9CW46 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Raver1Q9CW46 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Raver1Q9CW46 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Raver1Q9CW46 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Raver1Q9CW46 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Raver1Q9CW46 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Raver1Q9CW46 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Raver1Q9CW46 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms